Wybierz opcję: “Uwierzytelnij się w Krajowym Systemie e-Faktur”. 
Potwierdź oświadczenie i przejdź dalej. Na następnym ekranie będą do wyboru metody logowania. 
Pierwsza (niezalecana) to “Zaloguj się profilem zaufanym”. Wymaga złożenia wniosku ZAW-FA (https://www.gov.pl/web/ias-bialystok/kto-musi-zlozyc-zaw-fa-aby-korzystac-z-ksef-warto-zrobic-to-juz-teraz) lub nadania uprawnień na PESEL w aplikacji KSeF. 
Po kliknięciu należy podać NIP firmy. Wtedy trzeba będzie przejść procedurę logowania i podpisania dokumentu w przeglądarce. Druga to “Zaloguj się certyfikatem kwalifikowanym”. 
Podaj NIP i kliknij “Uwierzytelnij”. 
Potwierdź, że certyfikat zawiera numer PESEL lub NIP. Teraz należy kliknąć “Pobierz żądanie autoryzacyjne”. Pobierze się plik authv2_xxxxxxxx.xml, który należy podpisać pieczęcią NIP/podpisem kwalifikowanym z NIP 
Po podpisaniu pliku należy kliknąć “Dodaj plik” i wybrać podpisany plik xml i kliknąć “Dalej” 
Po weryfikacji powinien pojawić się główny ekran KSeF 
W lewym menu należy rozwinąć “Certyfikaty” i wybrać “Wnioskuj o certyfikat” 
Należy uzupełnić formularz. UWAGA: po kliknięciu “Generuj” klucz prywatny automatycznie pobierze się na komputer. 
Wybierz przeznaczenie “Uwierzytelnienie w systemie KSeF” i “Wyślij wniosek o wydanie certyfikatu” 
Co jakiś czas można kliknąć “Odśwież”, ponieważ strona sama się nie odświeży. 
Powinien pojawić się komunikat o sukcesie utworzenia certyfikatu. Teraz należy kliknąć “Pobierz certyfikat”. Na komputerze powinny być teraz dwa pliki certyfikat. Jeden z rozszerzeniem .key, a drugi .crt Oba pliki wraz z hasłem są potrzebne, aby zintegrować system z KSeF.
